Evolución de Stefan y Elena durante la tercera temporada

Klaus opina que ambos Salvatore no son buenos para la joven y que tendría que estar con alguien que le pueda dar una vida normal y humana como Matt, porque si sigue en medias de ambos puede que termine incluso muerta. Tras una dura noche ambos hermanos se sinceran y reconocen que aman a Elena.

3x14. Dangerous Liaisons. Elena recibe una carta de Esther, la madre delos orignales, invitandole al baile que realizan, Damon no quiere que asista pero Stefan opina que deberían averiguar que quiere. Cuando Damon le dice que por qué no vuelve a ser el antiguo Stefan que se preocupaba si Elena vivía o moría, Stefan le corta diciendo que eso era antes, que ahora es su trabajo. Pero Elena quiere ir y cuando Damon dice que ella no puede cuidar de sí misma Stefan dice que entonces irá él, aunque Damon les quita la invitación y dice que será el quien vaya.

Cuando llega Stefan es el primero en recibirla sorprendiendo a Elena, ninguno sabía que el otro estaría ahí. No van a marcharse hasta saber cuáles son los planes de Esther, así que la joven entra en el baile con un hermano de cada brazo.

Al rimo de Give Me Love de Ed Sheeran se disponen a bailan, aunque Elena comienza a bailar con Damon durante uno de los giros, Elena se encuentra con Stefan, ambos chocan se quedan mirándose y se ponen a bailar. Tratado de hacer la situación menos incomoda Elena ironiza con que Stefan está bailando y no ha tenido que suplicarle, Stefan responde  que la alcaldesa le arrastro y no pudo negarse.  Stefan empieza a recriminarle por Damon, pero a la vez le comenta que su hermano debería saber que ella puede cuidar de sí misma. Elena le observa a con un gesto de gratitud, ya que él no la trata como una niña y respeta su independencia, con ello le dice que tienen que hablar en privado.

Salen afuera para hablar, y Elena le pide ayuda para poder acercarse a Esther. Stefan pregunta que porque le pide eso y ella le contesta que Damon no le permitirá estar con ella sin protección y que él antepone vengarse de Klaus a todo. Las palabras de Elena hieren a Stefan que baja la mirada, pero cuando ella le pregunta si no es así que le dice que no se equivoca. Él le pregunta si está segura que puede hacerlo y con su afirmativa la deja ir, pero ella se gira y le comenta.

Al final de la noche Stefan la acompaña a su casa, y empiezan a hablar de los planes de Esther. Elena no quiere que Elijah muera, aunque Stefan le dice que va a morir Klaus y los demás no importan, que esa familia no le ha hecho nada más que mal. Stefan le comenta que debería llamar a su hermano y decirle que llego a casa a salvo, y comenta que fue tras Kol actuando de una manera autodestructiva porque ella dijo algo que no pretendía. Stefan está cada vez más destrozado y confiesa que él también lo hizo. Mira al suelo, después de todo lo que han pasado no puede creer que pusiera el vengarse de Klaus por encima de ella, pero lo que está hecho no puede deshacerse así que decide irse, y le desea buenas noches a Elena.

 Cuando se está marchando Elena no puede evitar ir tras él, ha visto que el hombre al que conocía y ama está ahí. Stefan tiene lágrimas en los ojos mientras Elena le pone las manos en el rostro, él confiesa que no quiere ser así, pero le retira las manos de manera brusca diciéndole que no puede permitirse sentir porque todo lo que siente es dolor.

3x15. All My Children. El episodio empieza con Elena llamado a Stefan, que ha vuelto a escribir en su diario, aunque él no le contesta. Más tarde nos damos cuenta como Stefan estaba dispuesto a convertir a la madre de Bonnie, pero su hermano decidió hacerlo por él, Damon se ha dado cuenta de que Stefan está intentando volver a ser el de antes, no ha vuelto a beber sangre humana desde que amenazo a Elena con lanzarla por el puente, aunque ella no lo sabe. Damon le confiesa que pensó que podría arrebatarle a Elena, pero ella no le quería.

3x16. 1912. Damon tiene un plan para que Stefan tolere la sangre humana, y junto a Rebekah le fuerzan a que se alimente de una muchacha, pero con la mala suerte de que Elena le descubre con la cara manchada de sangre.Stefan se queda helado, y lo único que hace es normbrarla, Matt toma a Elena del brazo y se marchan, y Stefan se gira destrozado, porque lo único que ha hecho ha sido empeorar las cosas, por lo que decide marchase en la dirección opuesta.

En casa de Elena y Matt y ella hablan de su relación con los Salvatore, ella está de acuerdo que no tiene sentido, pero al comienzo Stefan fue quien hizo que saliera de la depresión tras la muerte de sus padres, desde esos momentos tenía esa seguridad de estar con él, sabía que Stefan nunca dejaría de amarlay siempre estaría con ella.